国家中药种质资源库是保护中药资源、实现产业可持续发展的关键基础设施，是中药材种业发展的重要组成部分，建好用好种质资源库意义深远。
一、 战略定位
中药种质资源是国家战略资源，是中医药事业传承与发展的基石。在《中医药法》、《中医药发展战略规划纲要》等国家政策推动下，为保护资源、促进可持续发展而建立。
二、 核心作用与意义
1. 保护物种与遗传多样性，拯救珍稀濒危药用植物，保存野生种、栽培种及不同产地、品种的遗传多样性，为良种选育提供物质基础。
2. 支撑良种选育与质量保障，收集的丰富种质是选育高产、抗病、有效成分含量高的优良品种的关键，从源头保障中药材质量。
3. 服务生态与道地性研究，保存不同生态型的种质，有助于研究生态环境对药材质量的影响，指导生态保护与绿色栽培。
三、 核心任务与策略
1. 广泛系统收集。不仅收集物种，更注重收集同一物种内不同产地、表型、基因型的遗传多样性。
2. 深化种子生物学研究。明确种子贮藏特性属于正常型、顽拗型还是中间型，确定保存方式；研究种子寿命规律及贮藏劣变的生理与分子机制，填补研究空白；破除种子休眠障碍，以实现其研究和利用；
3. 制定安全保存与更新标准。通过监测，明确种子在库中保持高活力且遗传稳定的时间。建立定期检测制度，避免种子活力丧失。制定更新繁殖标准，确定种子发芽率下降到多少时需要重新繁殖更新，以保持遗传完整性。需建立有别于农作物的、适用于中药的标准。
四、已开展工作
1.公布了数个可利用中药材种质资源目录 ,截至 2024 年 3 月底 , 农业农村部共公布了两批《可供利用的农作物种质资源目录》,共有148种农作物类型和4万份种质资源 , 内含红花、桑 、苎麻等数种中药材种质资源 。
2.建立一批中药材种质资源库和保存圃 , 国家中医药管理局在中药资源普查基础上 ,已建成了成都 、海南 、北京 3 个中药材种质资源库，正在筹建湖南国家中药材种质资源库。
3.已保存资源 1. 4 万多份 ,并建设了 31 个药用植物种质资源保存圃 ,初步形成了中药材种质资源保存体系 ,包括了104 种中药材 。
资源库简介
国家药用植物种质资源库
中国医学科学院药用植物研究所承建。面向全国开展野生、栽培、珍稀濒危药用植物种质资源收集、保存工作。以种子保存为主，兼顾其它形式遗传材料保存。种质资源库位于中国医学科学院药用植物研究所内，总占地面积1500㎡，建筑面积500㎡，库体总面积150㎡，库容10万份，包括储存年限45-50年的长期库和储存年限25-30年的中期库及“双15”干燥间。与其配套的药用植物种子检测实验室已获得CMA资质认定，作为我国药用植物种子第三方检测平台，可为全国中药材种子质量检测提供技术服务。
国家南药基因资源库
又称为国家基本药物所需中药材种质资源库,是我国唯一的、收集保存顽拗性药用植物种质资源的国家级综合性种质资源库，位于海南省海口市国家高新区，由国家中医药管理局立项，依托中国医学科学院药用植物研究所海南分所建设和运行。国家南药基因资源库是在结合我国生态环境和中药资源特点的基础上，对我国南部热带和亚热带地区中药资源普查工作收集的种质资源进行收集保存，资源库包括液氮库、南药种质及种子检测实验室和种质交换使用服务中心等科研与服务体系，拥有保存20万份顽拗性药用植物种子、植物离体材料、DNA材料的先进设施，建成集种子收集、鉴定、检测和保存为一体的技术体系和科研平台，具备强大的顽拗性药用植物种质资源收集与保藏能力。
成都中医药大学国家中药种质资源库
国家中药种质资源库设计库容保存种质20万份，建筑面积2500平方米以上。包括：（1）药用植物种子低温低湿库和超低温库。长期库（-18℃、湿度﹤50%，保存50年）库容10万份；中期库（-4℃、湿度﹤45%，保存25～30年）库容5万份；短期库（4℃、湿度﹤50%，保存5年）库容5万份；以及超低温库。（2）药用生物离体材料库。含试管苗、愈伤组织、鳞茎、花粉等微繁殖体和培养物。（3）种质资源圃。特殊物种在成都中医药大学药用植物园、峨眉山等地建立资源圃，进行人工繁殖、保育与展示。（4）配套实验室。含收样室、干燥包装室、净度室、重量室、水分室、生化室、发芽室、组织培养室、质量评价室、数据中心、展示区等，用于种子入库前后的筛选、检测、干燥、包装及种质评价与利用。
国家中药材种质资源库（筹建）
2025年7月16日，湖南省人民政府与国家中医药管理局在长沙签署共建国家中药材种质资源库合作协议。集全国最优质的中药材种质和基因资源，集建库、建圃、建研究中心于一体。